Akaryakıt Birimi'nin misyonu ülkeye ithal edilen akaryakıtın ithalinden tüketimine kadar geçen her alanda denetim yapmak ve bu denetimlerin standartlara uygun olmasını sağlamaktır. Akaryakıtla ilgili bütün faaliyetlerin kalite ve emniyet standartlarına uygunluğunu sağlamak ve korumaktır. Kısacası tüketicinin daha kaliteli ve emniyetli hizmeti alabilmesini garanti altına almaktır.

Uluslararası standartlara uygun ve çevre ile uyumlu akaryakıt ürünlerinin ithal edilmesi ve bütün faaliyetlerin standart ve yeni teknolojilere uygun olmasıdır. Ayrıca akaryakıtla ilgili yatırım projelerinin çevre ile uyumlu ve fark yaratabilecek nitelikte olmasını sağlamaktır.Akaryakıt ürünlerinin daha tasarruflu ve verimli kullanımının sağlanması yönündeki teknolojileri desteklemek ve alternatif yakıtların kullanılması yönündeki projeleri desteklemektir.